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將遺傳編碼的光交聯(lián)技術(shù)應(yīng)用到組蛋白的化學(xué)修飾研究中

DATE:2017-05-16    來源:齊一生物科技(上海)有限公司    點(diǎn)擊數(shù):

近日北京大學(xué)化學(xué)學(xué)院陳鵬課題組與香港大學(xué)李祥課題組合作,將遺傳編碼的光交聯(lián)技術(shù)應(yīng)用到組蛋白的化學(xué)修飾研究中,相關(guān)成果以“Genetically Encoded Photoaffinity Histone Marks” 為題發(fā)表在美國化學(xué)會志 (JACS,DOI: 10.1021/jacs.7b01431)。

組蛋白的翻譯后修飾對于表觀遺傳調(diào)控及多種生物學(xué)過程具有重要意義。近年來,一系列新的賴氨酸化學(xué)修飾(如巴豆?;?、琥珀?;龋┎粩啾话l(fā)現(xiàn),展示出組蛋白修飾前所未有的多樣性及動態(tài)變化特征,但對于這些化學(xué)修飾的生物學(xué)機(jī)制與功能的認(rèn)識仍然模糊??蛇z傳編碼的光交聯(lián)探針已經(jīng)成為研究活細(xì)胞內(nèi)蛋白 - 蛋白相互作用的重要工具,該工作成功地將該技術(shù)拓展到組蛋白的化學(xué)修飾研究中,開發(fā)了可遺傳編碼的組蛋白光親和標(biāo)簽,將會極大地推動組蛋白化學(xué)修飾的識別機(jī)制和功能研究。

該技術(shù)的設(shè)計(jì)包括兩個部分:a)一套帶有翻譯后修飾的賴氨酸遺傳編碼系統(tǒng),可以在特定位點(diǎn)插入帶修飾的賴氨酸。此外,在賴氨酸的主鏈上還帶有光交聯(lián)基團(tuán),可在 UV 光下與修飾相關(guān)的蛋白發(fā)生共價(jià)交聯(lián),可以用于研究該修飾特定的效應(yīng)蛋白。b)一套帶有保護(hù)基團(tuán)的賴氨酸遺傳編碼系統(tǒng),保護(hù)基團(tuán)可以在大腸桿菌自身的還原性環(huán)境中發(fā)生脫除,將帶有光交聯(lián)基團(tuán)的賴氨酸定點(diǎn)插入到組蛋白當(dāng)中,用于證實(shí)交聯(lián)到的效應(yīng)蛋白的特異性。該團(tuán)隊(duì)以巴豆酰化修飾為代表,發(fā)展了該技術(shù)對應(yīng)的賴氨酸巴豆?;揎椀墓饨宦?lián)探針(K*cr)和帶有保護(hù)基團(tuán)的光交聯(lián)探針(PNBK*)兩個探針,將這兩種探針分別引入到組蛋白 H3 的 56 位和 79 位,并通過光交聯(lián)基團(tuán)捕捉到了 H3 上 79 位巴豆?;?a href="http://www.snti56.com/Biovision/BIO161206.shtml" target="_blank" _href="http://www.snti56.com/Biovision/BIO161206.shtml">去乙?;?Sirt3。

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