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二萜環(huán)化酶研究中取得進(jìn)展

DATE:2017-03-31    來源:齊一生物科技(上海)有限公司    點(diǎn)擊數(shù):

圖注:UbiA 家族二萜環(huán)化酶及其環(huán)化產(chǎn)物

二萜化合物是一類廣泛分布在植物、真菌、細(xì)菌和海洋生物中的天然化合物,結(jié)構(gòu)豐富多樣并且多具有很好的生物活性,包括臨床上用于治療癌癥的藥物紫杉醇(Taxol);治療心血管系統(tǒng)疾病的銀杏內(nèi)酯、丹參酮(Tanshinone)以及抗炎止痛的 pseudopterosin A 等。由于二萜化合物重要的醫(yī)用價(jià)值,負(fù)責(zé)其生物合成的二萜環(huán)化酶的研究近年來引起了極大的關(guān)注。

鳥巢烷二萜是一類主要由擔(dān)子菌(Cyathus, Hericium, Sarcodon, etc.)產(chǎn)生的天然產(chǎn)物,具有罕見的特征性的 5 /6/ 7 三環(huán)骨架和多樣的生物活性,包括抗菌、抗腫瘤、促進(jìn)神經(jīng)生長因子生長等。其中的 erinacine A 對(duì)老年癡呆的模型小鼠具有治療作用,有望開發(fā)成為治療老年癡呆的藥物。該類化合物化學(xué)全合成路線復(fù)雜,難以應(yīng)用。合成生物學(xué)的發(fā)展為鳥巢烷二萜的大規(guī)模制備提供了可能性,但迄今為止負(fù)責(zé)該類化合物生物合成的基因和酶仍然不清楚。

中國科學(xué)院微生物研究所劉宏偉研究組從猴頭菇、鳥巢菌屬真菌中發(fā)現(xiàn)了 20 個(gè)具有抗腫瘤活性的鳥巢烷二萜新化合物(Fitoterapia, 2013, 76, 45; Food Chem., 2014, 152, 169; J. Biol. Chem., 2015, 290, 23563;Eur. J. Med. Chem., 2016, 111, 183)。為便于開展鳥巢烷二萜的生物合成機(jī)制研究,該研究組與中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院藥用植物研究所研究員郭順星團(tuán)隊(duì)合作首次測(cè)定了猴頭菇的全基因組。在此基礎(chǔ)上,通過生物信息學(xué)、代謝產(chǎn)物譜以及定量 PCR 技術(shù)在猴頭菇(Hericium erinaceum)和隆紋黑蛋巢(Cyathus striatus)中確定了負(fù)責(zé)鳥巢烷二萜生物合成的基因簇;通過全基因合成、異源表達(dá)及酶催化活性研究首次鑒定了鳥巢烷二萜環(huán)化酶 EriG;以鳥巢烷二萜環(huán)化酶 EriG 基因序列為參考,通過基因組大數(shù)據(jù)挖掘,發(fā)現(xiàn) EriG 的同源蛋白廣泛分布在海洋細(xì)菌、鏈霉菌、粘細(xì)菌、藻類和真菌等多個(gè)類群中,進(jìn)一步的生物信息學(xué)分析表明 EriG 及其同源蛋白屬于 UbiA 異戊烯基轉(zhuǎn)移酶超家族中的全新成員,代表了一類全新的二萜環(huán)化酶;利用合成生物學(xué)方法從擔(dān)子菌和細(xì)菌中鑒定了該家族 7 個(gè)二萜環(huán)化酶的功能并發(fā)現(xiàn)了一個(gè)新骨架二萜化合物。

研究組的工作解決了長期以來困擾人們的鳥巢烷二萜環(huán)化酶的鑒定難題,拓展了人們對(duì)于 UbiA 異戊烯基轉(zhuǎn)移酶超家族蛋白生化功能的認(rèn)識(shí)和理解,豐富了二萜環(huán)化酶的類型,同時(shí)為鳥巢烷二萜的生物制備奠定了重要理論基礎(chǔ)。

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